Самыми часто анализируемыми стабильными изотопами являются кислород, углерод, азот, водород и сера. Эти изотопные системы изучаются многие годы для исследования изотопного разделения в природных системах, потому что они относительно легко измеряются.
Последние достижения в масс-спектрометрии теперь позволяют измерять тяжелые стабильные изотопы, такие как железо, медь, цинк, молибден и т. д.